導讀：一些致死率較高的癌症卻具有某些基因相似性，因此傳統的癌症分類方法可能已經不再適用於目前的癌症研究需求，需要進一步對於進行更新
遺傳變異
在過去的數年間，作為該計劃的一部分，研究者們報告了乳腺癌、結腸癌和肺癌中與其他癌症有關的驚人的基因變化。一種乳腺癌被認為與卵巢癌非常相似。而結腸癌中的一種基因變化常常在乳腺癌中發現。約有一半種類的鱗狀細胞肺癌可以由為其他癌症開發的藥物進行治療。
僅僅子宮內膜癌和白血病的項目，就吸引了100多名研究者的參與，他們研究了近400例子宮內膜癌和近200例白血病。子宮內膜癌是美國女性中最常見的婦科癌症， 每年有近5萬人發病，死亡約8000人。急性髓系白血病是最常見的成人急性白血病，在美國有約14,000萬人患病，死亡約10,000人。
參與這些研究的Dana-Farber癌症研究所(Dana-Farber Cancer Institute)的David P. Steensma博士說，“這是對癌症基因組領域的一次探索，醫學的許多發展是關於僅在一段特定時期內有效的療法或測試，直到一些更好的事物出現為止。但這些研究將在今後的200年裡都有效。這是一個經得起時間考驗的里程碑。”
4個不同的族群
紀念斯隆-凱特琳癌症中心的Douglas Levine博士是子宮內膜癌研究中的主要研究員，他說該研究組曾在全國搜尋這種癌症的病例。這種癌症曾一直由病理學家進行分析，他們在顯微鏡下分析子宮內膜腫瘤切片，並把它們分為兩大類。但這種方法並不理想。通常，其中一類預示著預後良好，這些腫瘤可以接受手術和放射治療，而另一類預後不良，並在手術後需要進行化療。但病理學家通常對如何劃分腫瘤存在分歧，並發現很難區分這兩個種類，Douglas Levine博士說。
在分析了數百種腫瘤後，這一新的基因分析法發現了能對腫瘤進行更精確分類的基因畸變模式，可以把腫瘤分為四個不同的類別。根據這一基因分析法，大約有10%按照老的檢查方法可以輕易治療的腫瘤如今似乎更具致命性，因而需要化療。研究人員下一步的工作將是明確哪些突變會分別導致好的或壞的結局。
另一個發現則是，很多子宮內膜癌病例中出現了只在結腸癌中出現過的基因突變。這一突變破壞了DNA損傷修復系統，其引發的突變次數是癌細胞通常突變次數的100倍。 “這完全出乎意料，” Douglas Levine博士說。事實證明，這是好消息。發生了這一突變的子宮內膜癌病例情況較好，這可能是因為累積起來的DNA損傷大大破壞了癌細胞。同樣讓人出乎意料的是，最嚴重的子宮內膜癌和大多數致命的卵巢癌及乳腺癌極為相似，從而增加了這樣一種誘人的可能性，即這三種致命的癌症可能會對同一種藥物起反應。
Fox Chase癌症中心癌症基因組研究所(Cancer Genome Institute at Fox Chase Cancer Center)的傑夫·博伊德(Jeff Boyd)說，乳腺癌、卵巢癌和子宮內膜癌這三種癌症之間的相似性極好地證明了，把癌症按基因突變分類比把癌症按起源部位分類更有效。儘管很多科學家認為這一觀點是正確的，但博伊德博士說，“這很有成效，但我不能誇大事實，”這還需要真實數據的驗證。博伊德沒有參與這一新研究。
迄今為止，儘管對子宮內膜癌的遺傳學研究在很大程度上還是空白，但對急性髓系白血病的研究已有幾十年曆史，這其中的部分原因是白血病細胞很易獲取，它們存在於血液和骨髓之中。
子宮內膜癌基因組
子宮內膜癌(Endometrial Carcinoma)是發生於子宮內膜的一組上皮性惡性腫瘤，好發於圍絕經期和絕經後女性，是最常見的女性生殖系統腫瘤之一。針對400多個子宮內膜癌患者，研究人員展開了研究，他們發現兩種子宮內膜癌腫瘤亞型：子宮漿液性癌(uterine serous tumor)和高分級卵巢子宮內膜樣腫瘤(endometrioid tumor)共同具有幾種遺傳突變。其中大約25%的分類為高分級卵巢子宮內膜樣腫瘤的腫瘤，實際上具有與子宮漿液性癌相似的遺傳特徵，例如TP53基因廣泛的拷貝數變異和頻繁突變。此外，子宮漿液性癌還與卵巢漿液性癌和基底細胞樣乳腺癌共有一些遺傳特徵。研究人員指出，與美國癌症基因組圖譜研究計劃所分析的其他癌症相比，正在研究的子宮肌瘤更容易發生突變。因此這可能會改變子宮內膜癌的分類方式，並為罹患這種癌症的患者提供機會測試新的治療方案。
急性髓細胞性白血病基因組
AML是成年人中最為常見的急性白血病類型，美國每年有1.4萬人罹患此病，1萬人因此死亡。在這篇文章中，研究人員分析了200名AML患者的基因組，從中發現了上百個基因突變，這些結果為基因組學引起的致命難治性癌症提供了新的見解。研究人員發現AML與其它成年人癌症相比，引起了相對較少的突變。癌症細胞在AML患者中平均有13個基因發生了突變。遠遠少於在乳腺癌，肺癌和其它實體腫瘤發現的幾百個基因。通過研究大量的AML病例，研究人員認為這些幾乎就是AML所有的突變基因。
研究人員根據基因的功能和涉及的信號通路將這些突變分成了9個類別。包括腫瘤抑制基因，信號基因和表觀遺傳學的修飾著。表觀遺傳學修飾基因是最常見的突變種類。表觀遺傳學的改變將會影響基因的開啟和關閉，但不影響DNA的排列序列。其中在確定的基因及基因組之間，研究人員發現了基因合作模式及互相排斥模式。比如，結合三個基因突變-FLT3，NPM1和DNMT3A-可能代表一個AML的獨特亞型。
這些研究表明，儘管癌變可能發生於人體的不同部位，但一些致死率較高的癌症卻具有某些基因相似性，因此傳統的癌症分類方法可能已經不再適用於目前的癌症研究需求，需要進一步對於進行更新。
關鍵字：#癌症特徵決定於基因圖譜而非發病器官
