食道癌能有如此高的死亡率，專家研究發現很大程度上來自於治療後的副作用，尤其是化療，因此處理好化療中出現的問題是極其重要的，化療是全身治療，化療藥物在殺滅癌細胞的同時，對人體正常細胞也有殺傷或損害的作用。這需要在治療中盡可能避免和減輕治療的副作用，在治療後注意身體的保健和復原。
確定治療目標和治療性質。要明確治療目的，制定適當的化療方案，不能隨意減少或加大藥物劑量，不能任意縮短或延長用藥週期的間隔時間。化療的成功與否，很大程度取決於如何處理好化療藥物的毒副反應問題。毒副反應與療效一樣，通常是劑量依賴性的，增加治療劑量、強度，可能提高療效，但毒性也隨之增加。
化療的副作用主要包括1、消化道反應2、局部刺激3、骨髓抑制4、皮膚黏膜的損5、有些化療藥對中對臟器造成損害噁心嘔吐、厭食的防治及營養。
消化道副反應出現時，應視情況考慮不進食，或減少進食，避免吃油膩、不消化或刺激性強的食物。
化療引起血像下降的防治：使用一些升白血球或升血的藥物，必要時可輸注濃縮血小板或白血球，也可使用造血生長因子。化療引起掉髮的防治：脫發者在化療停藥後3—6個月，頭髮仍能生長。脫髮的病人可用中性香波洗頭，並儘量減少洗頭次數；頭髮濕時不要三硬梳通，待乾後慢慢梳理，梳理次數也應減少；最好不要燙頭髮。
在治療期在飲食上可作一些適當調整，一般不主張過多的高蛋白飲食。使用鎮靜止吐藥，必要時補液，保持水電解質平衡。在康復期，膳食應符合營養平衡要求，適當增加動物性蛋白質和較豐富的豆類食品；避免高鹽飲食，每天鹽攝取量不超過10克。每天有一定量的新鮮蔬菜，增加多種維生素；盡量少吃或不吃醃製食物；提倡吃一些粗糧，保證有足夠的飲食纖維素。
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